Sarana dan prasarana Departemen Mikrobiologi Pertanian pada Gedung A2b terletak di lantai 1, yang terdiri dari:
A. Laboratorium Barat
Laboratorium Barat terdiri dari beberapa ruang, yaitu:
1.Ruang Laboratorium
2.Ruang Dosen (Prof. Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D., Dr. Ir. Sri Wedhastri, M.S., dan Desi Utami, S.P., M.Sc., Ph.D.)
3.Ruang Instrumen
4. Ruang Komputer
5. Ruang Preparasi
6. Ruang Bahan Kimia
B. Laboratorium Timur
Laboratorium Timur terdiri dari beberapa ruang, yaitu:
1.Ruang Laboratorium
2.Ruang Dosen (Nur Akbar Arofatullah, S.P., M.Biotech., Ph.D.)
3.Ruang Inokulasi Jamur
4.Ruang Inokulasi Bakteri