Sarana dan prasarana Departemen Mikrobiologi Pertanian pada Gedung Agrotropica LEarning Center (AGLC) terletak di lantai 4, yang terdiri dari:
A. Ruang Administrasi
B. Ruang Preparasi
C. Lab. Mikrobiologi Tanah dan Lingkungan
D. Lab Genetika Mikrobia
Lab Genetika Mikrobia terdiri dari:
1.Ruang Lab. Genetika Mikrobia
2.Ruang Dosen (M. Saifur Rohman, M.Eng., Ph.D.)
E. Lab. Ekologi Mikrobia
Lab. Ekologi Mikrobia terdiri dari:
1.Ruang Lab. Ekologi Mikrobia
2.Ruang Dosen (Ahmad Suparmin, S.P., M.AgrSc., Ph.D.)
F. Lab. Fisiologi Mikrobia
Lab. Fisiologi Mikrobia terdiri dari:
1.Ruang Lab. Fisiologi Mikrobia
2.Ruang Dosen (Susanti Mugi Lestari, S.P., M.Si., Ph.D)
