Sarana dan prasarana Departemen Mikrobiologi Pertanian pada Laboratorium Terpadu Agrokompleks terletak di lantai 1, yang terdiri dari:
A. Laboratorium Riset Utara
B. Laboratorium Riset Selatan
Laboratorium Riset Selatan terdiri atas:
1.Ruang Laboratorium Riset
2.Ruang Dosen (Ir. Jaka Widada, M.P., Ph.D. dan Agung Dian Kharisma, S.Pd.Si., M.Biotech., Ph.D.)
C. Laboratorium Pendidikan/Lab. Biokimia
Laboratorium Pendidikan/Lab. Biokimia terdiri atas:
1.Ruang Laboratorium Pendidikan
2. Ruang Instrumen
3. Ruang Bahan
4. Ruang Staf
5. Ruang Sidang
